弗朗斯瓦·马蒂主要从事有机磷化学研究。他开创并深入进行了磷杂环化学，有机磷配合物和低配位磷化学等领域的研究。这些研究加深和拓展了人类对有机磷化合物的认识，促进了有机磷化学的发展和应用。为表彰他在该领域做出的杰出贡献，他先后被授予主族化学奖（1999年）和阿布佐夫奖（2001年）等国际奖项。已发表论文560多篇,被引用12100次，H指数为49。

弗朗斯瓦·马蒂对中国和中国科学界一直怀有友好感情，在上世纪80年代，他就来过中国，访问了科学院和北京大学等科研教学单位。此后，他多次访问中国，热情邀请我国的专家、学者到法国开展合作研究，多渠道支持中国科技事业发展。为促进中国中西部地区的科技事业发展和对外交流合作，他克服语言环境和生活习惯等重重困难，在河南创立了国际磷化学实验室，《美国化学化工新闻》专门就此事进行了报道。2008年，在郑州大学开展了磷杂卟啉、低配位磷和含磷功能材料等领域的研究，已在Angew. Chem. Int. Ed., J. Am. Chem. Soc.等期刊发表论文10余篇。他迄今已为我国培养博士后、博士、硕士研究生和本科生50多名。同时积极促成郑州大学与法国科学院建立了长期合作关系，联合法国科学院和雷恩第一大学建立了“中法有机磷功能材料实验室”。 促成郑州大学与新加坡南洋理工大学建立合作，使得郑州大学化学系本科推免生可以到南洋理工大学继续深造。他每年在郑州主持召开国际学术会议，迄今已邀请30余名国内外著名专家﹑学者前来开展学术交流与合作，这为中西部地区的对外交流与合作搭建了一个高端平台。鉴于弗朗斯瓦·马蒂长期以来为我国人才培养和对外科技交流所作出的突出贡献，获得了2009年度中国政府“友谊奖”。